作者:尧良清教授 2024-07-24
从检测对象的时空顺序来看,HRR检测意在“因”,HRD score检测旨在“果”。
同源重组是一个系列性的生物学现象,非常复杂,这里面涉及的基因有很多,其中任何一个基因发生缺陷都可能导致同源重组缺陷。HRR检测即是一种寻“因”的检测。
但是现在国内外对同源重组基因(HRR)的定义均不明确,HRR基因的准确个数是多少,每一个基因的贡献权重是多少,目前还不清楚。
—般公认的为[2]:ATM,ATR,BARD1,BLM,BRCA1, BRCA2,BRIP1,CHEK2,MRE11A,NBN,PALB2, RAD51C,RAD51D,RBBP8,SLX4,XRCC2。
另外,能造成同源重组修复功能缺陷的,除了HRR还有很多其他因素,比如HRR基因的甲基化、或一些其他的未知原因——检测难度大、或不可测。
所以HRR检测,并不能将同源重组缺陷患者“一网打尽”。
为了尽可能的找出所有的HRD患者,临床工作者另辟蹊径,从HRD的“果”入手寻找到了一种检测方法——HRD score检测。
若患者存在同源重组修复功能缺陷,为了最低程度的维持基因组的稳定,机体会启用备用的一种修复方式——非同源末端连接修复(NHEJ)。而NHEJ修复不是一种高保真的修复方式,而是一种简单粗暴的修复方式,要么直接把断裂直接连接起来,要么拆东墙补西墙“胡乱”修补。
值得一提的是,基因组中99%是内含子,所以这种修复方式大概率上不会影响正常的生理过程,即便有影响,也比基因组断裂得不到修复的后果要弱得多。
NHEJ修复会导致基因组中某些位置的DNA序列要么被切除,要么被其他序列所替代,相比于正常的基因组,这种序列的切除或替代,类似于“疤痕”,有别与“正常”。
检测这些“疤痕”,即是HRD score检测的基本原理。
HRD score检测绕开了复杂的寻因过程,巧妙的从HRD导致的结果入手,进行检测,将HRD阳性患者“一网打尽”,实现了卵巢癌PARP抑制剂获益人群的最大化。
参考文献:
[2].British Journal of Cancer (2012) 107, 1776–1782
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